Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2AP11388 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOP2AP11388 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms