Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms