Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGKV1-13P0DP09 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms