Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
U2AF1L5P0DN76 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms