Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms