Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47B1P0C2W7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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