Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIL1P09327 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIL1P09327 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIL1P09327 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIL1P09327 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms