Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP10P09238 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP10P09238 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP10P09238 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP10P09238 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP10P09238 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP10P09238 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP10P09238 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP10P09238 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms