Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC3A2P08195 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC3A2P08195 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC3A2P08195 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC3A2P08195 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms