Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINC1P01008 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINC1P01008 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINC1P01008 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINC1P01008 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINC1P01008 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SERPINC1P01008 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINC1P01008 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms