Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCNTO95613 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCNTO95613 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCNTO95613 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCNTO95613 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCNTO95613 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms