Protein–RNA interactions for Protein: O95406

CNIH1, Protein cornichon homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1O95406 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNIH1O95406 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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