Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB11O95342 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB11O95342 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms