Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCAO15360 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCAO15360 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCAO15360 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCAO15360 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCAO15360 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCAO15360 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms