Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN34H7C241 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN34H7C241 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms