Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C1D1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C1D1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C1D1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C1D1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C1D1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms