Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L21D6R901 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms