Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms