Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms