Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms