Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL13PA6NNM8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL13PA6NNM8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL13PA6NNM8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL13PA6NNM8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms