Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms