Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms