Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC4A9-205ENST00000507527 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL035696.1-201ENST00000381078 2007 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRS2-201ENST00000274747 3821 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARM1-201ENST00000307428 5011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTRK3-207ENST00000542733 2287 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOL8-229ENST00000545558 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP12A-202ENST00000381946 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 THUMPD3-201ENST00000345094 3961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP25-201ENST00000362449 308 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A4-203ENST00000368715 573 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR503-201ENST00000385270 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245452.3-201ENST00000413294 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PUDPP1-201ENST00000421058 495 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTG1P24-201ENST00000423783 877 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092042.3-203ENST00000443313 950 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL096701.1-201ENST00000445477 457 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP4F25P-201ENST00000446871 520 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL666P-201ENST00000460953 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL231P-201ENST00000461840 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL359P-201ENST00000473502 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL250P-201ENST00000475154 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM197Y9-203ENST00000505707 345 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013290.1-201ENST00000586960 537 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP357-201ENST00000607318 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BSNDP1-201ENST00000613026 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM2-202ENST00000617002 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6834-201ENST00000622807 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 C11orf44-201ENST00000317019 3547 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NWD1-205ENST00000549814 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EREG-201ENST00000244869 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPOCD1-214ENST00000533231 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms