Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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