Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms