Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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