Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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BPTFQ12830 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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