Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms