Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLS1-202ENST00000457734 3706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf96-201ENST00000444310 3823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BARD1-210ENST00000613374 4096 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FLT4-206ENST00000502649 4140 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ORC2-201ENST00000234296 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL15-203ENST00000406787 4304 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HPCAL4-203ENST00000617690 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098679.1-201ENST00000503611 2917 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPH-201ENST00000325590 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SCFD2-202ENST00000401642 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K1-205ENST00000381879 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNE1-201ENST00000337385 3347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A3-211ENST00000584306 5665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NSUN7-202ENST00000381782 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB9-206ENST00000442028 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073464.2-201ENST00000412994 343 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157401.1-201ENST00000419836 344 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL10P5-201ENST00000427719 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL160270.2-201ENST00000441226 473 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPSAP26-201ENST00000442699 741 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OGFRP1-203ENST00000446578 551 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 USF1P1-201ENST00000451645 526 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390778.1-201ENST00000452377 527 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL449P-201ENST00000464937 286 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P37-201ENST00000486874 495 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010768.1-201ENST00000533814 543 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2D-40-202ENST00000560045 312 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099524.1-205ENST00000562180 674 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011500.2-201ENST00000600089 440 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008737.1-201ENST00000600987 371 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAS-AS1_2.1-201ENST00000613404 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM2-202ENST00000617002 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2-40-202ENST00000621595 312 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC048380.3-201ENST00000623145 796 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms