Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MTMR3Q13615 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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