Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms