Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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