Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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