Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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