Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms