Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CENPFP49454 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CENPFP49454 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CENPFP49454 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CENPFP49454 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CENPFP49454 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CENPFP49454 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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CENPFP49454 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CENPFP49454 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CENPFP49454 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CENPFP49454 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CENPFP49454 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CENPFP49454 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CENPFP49454 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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