Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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MTSS1O43312 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MTSS1O43312 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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