Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CIPCQ9C0C6 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CIPCQ9C0C6 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CIPCQ9C0C6 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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