Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRN4Q8WUT4 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms