Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms