Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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