Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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