Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms