Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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