Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LMAN2Q12907 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms