Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CIPCQ9C0C6 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms