Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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