Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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