Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms